میلیون ها سال پیش زمین با خطر انقراض روبرو بود. از طریق یک نبرد فضایی حماسی بین زمینی ها و مخالفانشان، زمینی ها از گونه ها و فرهنگ های مختلف سعی می کنند از سیاره شان دفاع کنند...
اولین فیلم کاپیتان سوباسا درباره بازی بین "تیم پسران تمام اروپایی" و "تیم پسران تمام ژاپنی" هستش و در ادامه اولین سری سریال اتفاق می افته. بعد از اینکه پسران ژاپنی پا به اروپا میذارن با تیم های قوی و سرسختی مواجه میشن که هر کدوم یک ترفند جدید رو به رخ اون ها میکشن.. با این که اونا دوقلو های تاچیبانا رو دارن، اما کاپیتان آلمانی ها به اسم کارل هنز اشنایدر انگار هیچ راه نفوذی به اونها نمیده. تا این که واکیبایاشی پیداش میشه...