در آینده‌ای که پیشرفت‌های تکنولوژیکی و رباتیک به امری عادی تبدیل شده‌اند، سرگرد موتوکو کوساناگی و بخش ۹ وظایف دشواری را که از عهده پلیس خارج است، بر عهده می‌گیرند. بخش ۹ از هکرها، تک تیراندازان، کارآگاهان و سایبورگ‌ها برای خنثی کردن مجرمان سایبری و نقشه‌های آنها برای حمله به افراد بی‌گناه استفاده می‌کند.
در آينده‌اي اتمي زده ، نژاد انسان چندين برابر پسرفت مي‌کند. مردمان عادي به برده تبديل مي‌شوند، در حالي که غول‌هاي ژنتيکي بر دنيا فرمانروايي مي‌کنند . باروت اسلحه‌ها به تاريخ پيوسته و هنرهاي رزمي تنها سلاحي‌ست که انسان مي‌تواند داشته باشد. دو مدرسه در جنگي بر سر قلمرو روبه‌روي يکديگر قرار مي‌گيرند : "هوکوتو" و "نانتو". کنشيرو جانشين حقيقي مدرسه "هوکوتو" و "شين" جانشين "نانتو". "شين" دوست "کن"، "يوريا" را مي‌دزدد و "کن" دنبال او مي‌گردد. "کنشيرو" در ميان خرابه‌هاي جنگ اتمي براي نجات "يوريا" سفر مي‌کند. در حين جلو رفتن داستان، با شش استاد اعظم مدرسه‌ي "نانتو سيکن" و سه برادر ناتني "کنشيرو" که هنر "هوکوتو شينکن" را آموزش ديده‌اند آشنا مي‌شود. سرانجام، حريف نهايي "کنشيرو" کسي نيست جز برادر بزرگ او، "رائوه"، جنگجويي که قصد فتح دنيا را دارد و "کنشيرو" را به عنوان جانشين شايسته قبول ندارد.
6.3-
8.38.8