داستان هیتومی کانزاکی، دختری نوجوان است که به طور ناگهانی به سیارهای مرموز منتقل میشود. او در آنجا درگیر نبردهای بین امپراتوری زاییباخ و کشورهای صلحآمیز میشود. امپراتوری زاییباخ به دنبال احیای قدرت افسانهای از شهر باستانی آتلانتیس است.
ساکورا در یک کتابخانه به کتابی پر از کارتهای سحرآمیز به نام کلو برخورد میکند. وقتی اشتباهاً کارتها را آزاد میکند، باید با همراهی دوست صمیمیاش تومویو و نگهبان کارتها، کروبروس، تلاش کند تا همه آنها را دوباره جمع آوری کند.
پس از پیروزی قاطع بر تایتان ها، خدمه آرگاما از ائوگ (به همراه گروهی از بچه های تازه وارد)، فرصت چندانی برای جمع شدن ندارند چون خطر جدیدی در دوردست ها مشخص می شود: نئو زئون هامان!