پس از پایان جنگ و برقراری صلح، خلبانان گاندام به زندگی عادی بازمیگردند و گاندامهایشان نابود میشوند. اما با پدیدار شدن دختر گمشده رهبر سابق، ماجرا وارد مرحله جدیدی میشود.
زندگي در ژاپن فئودال آسان نيست. خصوصا حالا که فضاييها آمده و همه چيز و همه جا را به تصرف خود درآوردهاند! خب البته، اوضاع بيمه و بهداشت عالي شده، اما ممنوعيت عمومي استفاده از شمشير، بسياري از ساموراييهاي شکستخورده را با تصميم سختي روبهرو ساخته که همانا انتخاب مسير زندگي آيندهشان است! اين موضوع، خصوصا در مورد افرادي از جمله گينتوکي ساکاتا صدق ميکند که به شغل درازمدت و منظمي پايبند نيستند. اين شد که گينتوکي، دنبال شغل آزاد رفته و هر کاري به او پيشنهاد شود، ميپذيرد، البته تا جايي که حقوق آن به اندازهي کافي باشد. اما ...
در سال 0153، امپراتوری زانسک بر مستعمرات فضایی ساید 2 حاکم شده و با خشونت بیرحمانه، به خصوص استفاده از گیوتین، بر مردم حکومت میکند. این امپراتوری قدرتمند، با حمله به زمین و تهدید سایر مستعمرات فضایی، به دنبال گسترش قلمرو خود است. در این شرایط بحرانی، تنها نیرویی که در مقابل زانسک ایستادگی میکند، لیگ میلیتار است که با استفاده از رباتهای جنگجوی پیشرفته و خلبانان جوان و شجاع، به مبارزه با این امپراتوری ظالم میپردازد. اوسو ایوین، پسری سیزده ساله، به طور اتفاقی وارد این جنگ میشود. او که به عنوان خلبان یک ربات جنگی بسیار قدرتمند به نام گاندام پیروزی انتخاب شده، برای نجات سیاره و یافتن والدین گمشدهاش که سالها پیش او را ترک کردهاند، میجنگد.
بشر به فضا رفته است. هزاران نفر در مستعمرات فضایی بزرگ مداری که «ساید» نامیده میشوند زندگی میکنند. اما دولت زمین که مستعمرات را اداره میکند، بیعدالت و ظالم است. گروهی از انقلابیون پنج سلاح رباتیک به نام گاندام ساخته و قصد دارند آنها را به زمین بفرستند تا نبرد خود را برای استقلال آغاز کنند. این گاندامها توسط پنج جوان خلبان رانده میشوند که امیدها و رویاهای آزادی ساکنان مستعمرات را با خود همراه دارند وقتی که به زمین فرود میآیند تا عملیات شهاب را شروع کنند.