هزاران سال پیش، آلفا پوکمون آرسیوس افسانهای به زمین آمد تا جواهر زندگی را که به مردی به نام داموس قرض داده بود، پس بگیرد - اما داموس به آن خیانت کرده و با ارتش بزرگی از پوکمون به آرسیوس حمله می کند...
"کویچی اوهارا" یک دانش آموز کلاس چهارم میباشد که در حومه ی توکیو زندگی میکند. روزی، او یک سنگی را پیدا میکند که مشخص میشود یک "کاپا" میباشد که از خواب زیرزمینی 300 ساله بیدار شده ...
کنیچی میتسوبا پسر ۱۱ سالهای است که در مدرسه راهنمایی درس میخواند ولی با درسهایش مشکل دارد. او خیلی سرکش و تنبل است و همیشه پدر و مادر و معلمش را عصبانی میکند. او دوست دارد کارها را به راحتی انجام دهد. او با هاتوری کانزو، نینجایی از قبیله ایگا، دوست میشود و به خانواده میتسوبا میپیوندد. برادرش شینزو و سگ نینجایش شیشیمارو هم با او هستند. هاتوری به کنیچی در حل مشکلاتش کمک میکند و چشم بر روی او نگه میدارد. دشمن اصلی آنها کموماکی است، نینجایی از قبیله کوگا، که با گربه نینجایش کاگچیو همراه است. او همیشه برای کنیچی دردسر درست میکنه، بخصوص وقتی که با یومیکو، دختری که هر دو به او علاقه دارند، رقابت دارد. کنیچی معمولا از هاتوری میخواهد که برایش انتقام بگیرد. گاهی هاتوری و کنیچی با هم دعوا میکنند به خاطر سوء تفاهمهای کموماکی. جیپو، توگجیر و تسوبام هم گاهی به آنها کمک میکنند.
داستان انیمه درباره سای آکوتو، پسری که میخواهد تبدیل به بزرگترین جادوگر شود. برای رسیدن به این آرزو وارد یک آکادمی جادو میشود و در اولین آزمون مشخص میشه که شغل آینده اون (پادشاه شیاطین) است و به این ترتیب زندگی آکادمی آکوتو آغاز میشه.
سارا، دختری که در یک خانواده مرفه در هند به دنیا اومده، در یک مدرسه خوابگاهی در لندن باهاش مثل یک شاهزاده کوچک برخورد میشه. زندگی مدرسه ای شیرین سارا، وقتی که از مرگ پدر و ورشکستگی خانواده ش با خبر میشه به یک تراژدی تبدیل میشه.
چهارده سال پس از شکست دادن مبارز افسانه ای هیمورا گنما و برملا کردن نقشه هی شوم شوگان ، شخصی به اسم کیباگامی جوبی به عنوان شمشیر زنی شکست ناپذیر در سرتاسر ژاپن پرسه میزند. در میان ماجراجویی خود در ژاپن به یک کشیش به اسم شوگی آشنا میشود که تاکنون جایی جز روستای خود را ندیده است و از دنیا بیرون بی خبر است. اما پس اینکه شیاطین روستایش را غارت میکنند و تمام اهالی آنجارا میکشند جوبی به هدف اصلی آنها تبدیل میشود زیرا سنگ اژدها که بسیار اسرار آمیز است را بدست آورده است. حال دو قبلیه ی شیطانی میخواهند شیگوره را اسیر کنند و بار دیگر داکویان باید از کشیش نور مواظبت کند …