قبل از شروع قسمت اول، ساکورا همه کارتهای جادویی را به شکل جدید درآورد و حالا وقت آن رسیده است که با دوستش شائوران که میخواهد به چین برگردد، خداحافظی کند.
آینده کره زمین توسط موجوداتی هیولا شکل که به «فرشته» معروف هستند، تهدید می شود. یک سازمان امنیتی بنام NERV برای مقابله با این تهدید گروهی از خلبانان جوان را به کار گرفته است...
زیر حملات دائمی فرشتگان،"نرو" دو خلبان جدید را معرفی می کند،"ماکینامی" اسرارآمیز و "آسوکا" قدرتمند.در همین حین "گندو ایکاری" و "سیل" پروژه ای مخفی را پیش می برند و...
پس از اتفاقات فیلم دوم کارتکپتر ساکورا: کارت مهربانی، کرو و اسپینل یک سینی تاکویاکی (غذای درست شده از هشتپای دریایی) را با هم میخورند. وقتی فقط یک قطعه باقی مانده، با هم به جر و بحث میافتند و در حین دعوایشان، آخرین قطعه را از پنجره بیرون میاندازند. آنها هر دو دنبال تاکویاکی و همدیگر میدوند و با تمام قوا سعی میکنند «فاتح تاکویاکی» بشوند.
ساکورا تمام کلوکارتها رو جمع و اونا رو تبدیل به ساکوراکارت کرده و حالا ارباب جدید کارتهاست. اون داره برای بازی در نقش اصلی یه نمایش آماده میشه. اما نیروی اسرار آمیزی که در سراسر توموئدا پخش شده، داره کارتهای ساکورا رو یکی پس از دیگری ازش میدزده. ساکورا با کمک شائوران، باید راهی برای غلبه براین نیرو و نجات شهر و دوستانش پیدا کنه .....
یک خواننده پاپ، پس از کنار گذاشتن حرفه خود برای بازیگری، توسط یک طرفدار وسواسی و روحی شبیه به گذشته خود مورد آزار و اذیت قرار می گیرد. این اتفاقات باعث می شود که او به آرامی دیوانه شود.
ساکورا برنده ی یک تعطیلات زمستانی به هنگ کنگ شده ولی آیا این واقعا به خاطراینه که اون دختر خوش شانسیه یا این که دست سرنوشت اون را فراخوانده تانیروهای شر را از میان ببره! وقتی وارد هنگ کنگ میشه توسط دو تا پرنده یعجیب و غریب تعقیب میشه و سر از مکان ناشناخته ای در میاره در اونجا میفهمهکه توسط زنی به اسم مادوشی به هنگ کنگ فراخوانده شده بوده که در تدارکگرفتن انتقام از کلاو رید است پس ساکورا دست به کار میشه تا با کمک مادرساوران و کمک یِلان و البته صدای کلاو رید که هدایتشون می کنه با مادوشیمقابله کنه و دوستانش را که در دام اون اسیر شدند را نجات بده
اوایل قرن 21 شهاب سنگی در قطب جنوب سقوط کرد وقتی دانشمندان برای تحقیق به محل حادثه اعزام شدند انفجار دیگری رخ داد که به “Second Impact” طبقه بندی شد. شینجی ایکاری پسری 14 ساله که برای دیدن پدرش به شهر Tokyo3 اومده شهری قلعه مانند که توسط مجودات غول پیکری به نام “Angels” به محاصره در اومده و...
هانتر ( به معنی شکارچی ) فردیه که دور دنیا سفر میکنه و هر جور ماموریت خطرناکی که فکرشو بکنید انجام میده . از دستگیر کردن مجرم ها گرفته تا کنجکاوی و جستجوی سرزمین های ناشناخته به دنبال گنج . گون ( Gon ) پسر جوونیه که پدرش چندین سال پیش ، موقعی که یه هانتر بوده ، ناپدید شده . گون باور داره که اگه بتونه پا جای پای پدرش بزاره ، ممکنه یه روز بتونه دوباره بهش بپیونده . بعد از اینکه گون 12 سالش میشه ، خونه رو ترک میکنه و ماموریت شرکت در آزمون " هانتری " رو امتحان میکنه . آزمونی که بخاطر پیشرفت کندی که آزمون دهنده داره و درصد بالای مرگش برای هانتر رسمی شدن حسابی معروف شده . گون با کوراپیکا که به عشق انتقام زندست ، با لوریو که میخواد در آینده دکتر بشه و با کیلوآ که قبلا یه قاتل سرکش بوده دوست میشه . و همین جور که ماموریت های سخت تری رو ، به عنوان یه هانتر ، پشت سر میزارن و با خطرات و تهدیدهای بیشتری رو به رو میشن که باعث میشه رفاقتشون گسترده تر میشه.
ساکورا در یک کتابخانه به کتابی پر از کارتهای سحرآمیز به نام کلو برخورد میکند. وقتی اشتباهاً کارتها را آزاد میکند، باید با همراهی دوست صمیمیاش تومویو و نگهبان کارتها، کروبروس، تلاش کند تا همه آنها را دوباره جمع آوری کند.
آریکا یومیمیا در جستجوی هدف خود بسیار سفر کرده است: آکادمی معتبر Gualderobe. این مدرسه ای است که در آن دختران جوان برای تبدیل شدن به اوتوم ها، محافظان رهبران سلطنتی در سراسر سرزمین ها آموزش می بینند. در اینجا، آریکا دوستان زیادی پیدا می کند، اما برخی از دشمنان چیزهایی درباره گذشته او می دانند که او نمی داند. با این وجود، روحیه و اراده او همچنان او را به جلو سوق خواهد داد.
ساتائو تاشیرو یک مرد جوان 22 ساله است که نه کار می کند، نه دانش آموز است ونه کار آموز و یه هیکیکوموریه ( به معنی کناره گیری شدید از اجتماع) است. او معتقد است که همه چیز در اطرافش توطئه چینی است و این دلیل این است که بسیاری از مردم او را هیکیکوموری می نامند. در این هنگام ساتائو یک نقشه بزرگ می کشد که شامل هیکیکوموریه کایوکای ژاپنی است(NHK) , یک سازمان سری با قصد ایجاد کردن دنیایی بدون هیکیکوموری . ساتائو تصمیم می گیرد خود را از چنگال NHK رها کند اما نمی تواند چون او می فهمد که بیرون رفتن از خانه برایش ترسناک شده. این وضع ادامه دارد تا وقتی که او میساکی ناکاهارا را ملاقات می کند او ساتائو را برای اجرای نقشه اش انتخاب کرده و ادعا می کند که می تواند او را از شر هیکیکوموری خلاص کند.
در دوران خشونتآمیزی که با عنوان باکوماتسو شناخته میشد، یک قاتل ایشین که فقط با نام هیتوکیری باتوسای[۱] شناخته میشد، مهارت و خشونتش به مانند افسانهای در عصر بازگرداندی شده بود که او نیز نقش بسزایی در پیروزی انقلابیون داشت. با نزدیک شدن به اتمام زمان جنگ، بدون اینکه هیچ رد پایی از خود به جای بگذارد ناپدید شد، و یازده سال بعد فقط به عنوان یک شمشیرزن سرگردان با نام «هیمورا کنشین» به پا خاست. او به مکانهای مختلفی مهاجرت میکند تا به منظور جبران و کفارهای برای کشتار و گناهانی که در گذشته مرتکب شده باشد و بتواند از مردم عادی محافظت کند...